Editverseの無料チャートツール – GraphPro
GraphPro – 研究者向け無料オンライングラフ作成ツール – 25種類のグラフタイプと統計機能内蔵
データを貼り付けるだけで、出版準備万端の棒グラフ、箱ひげ図、散布図、フォレストプロット、カプラン・マイヤー曲線、その他20種類以上のグラフをブラウザ上で直接作成できます。6種類のグラフでは、作成時に有意性検定（t検定、ANOVA、相関分析、カイ二乗検定）が自動的に実行され、それぞれ正確なp値が表示されます。また、すべてのグラフはPowerPointやInkscapeで編集可能なSVG形式でエクスポートできます。登録は不要で、データはブラウザから外部に送信されません。
簡単な言葉で言うと
Editverse GraphProは、研究者の実際の作業方法に合わせて特別に設計された無料のグラフ作成ツールです。スプレッドシート形式のグリッドにデータを貼り付けるか入力し、グラフの種類を選択するだけで、ツールがグラフを描画します。散布図、箱ひげ図、バイオリンプロット、誤差棒グラフ、相関行列、棒グラフの6種類のグラフについては、対応する統計検定を自動的に実行し、グラフの横に正確なp値を表示します。
どのグラフやテストが自分の質問に適しているか分からない場合は、クイック分析ツールが、2つのグループを比較しているのか、3つ以上のグループを比較しているのか、あるいは2つの変数に関連性があるかどうかを確認しているのかを分かりやすい言葉で尋ね、適切なグラフを作成し、適切なテストを自動的に実行します。
このツールを使うタイミング
論文、学位論文、学会ポスターなどに図表が必要になった時、データを見ながら、その差が本当に存在するのかどうかを知りたいと思ったら、GraphProがまさにうってつけです。ウェルチのt検定または一元配置分散分析が組み込まれた箱ひげ図を使えば、同じ画面上で両方の疑問に答えることができます。これは、1つのツールでグラフを作成し、別のツールで検定を実行するよりもずっと速い方法です。
グラフではなく単一の確認数値が必要な場合は、Editverseの専用計算ツールがより詳細な分析を提供します。t検定計算ツール、相関係数計算ツール、カイ二乗計算ツールは、同じ統計情報をより詳細な診断情報とともに報告します。グラフ自体が必要な場合はGraphProを、検定結果を単独で記述する必要がある場合は計算ツールを使用してください。
統計機能を内蔵した無料オンライングラフ作成ツール
Editverse GraphProは、研究者向けの無料のブラウザベースのグラフ作成ツールです。棒グラフ、折れ線グラフ、散布図、箱ひげ図、相関行列、フォレストプロット、カプラン・マイヤー曲線など、25種類ものグラフを作成し、それぞれPowerPointやInkscapeで編集可能なSVG形式でエクスポートできます。6種類のグラフには、ウェルチt検定、一元配置分散分析、ピアソン/スピアマン相関係数、カイ二乗独立性検定といった有意性検定機能が組み込まれており、それぞれ正確なp値が表示されます。
- 棒グラフ／縦棒グラフ — グループ間で値を比較する
- 折れ線グラフ — 順序付けられた軸上の傾向
- 面グラフ — 塗りつぶされた大きさの傾向
- 散布図 — 2つの変数間の関係
- 円グラフ／ドーナツグラフ — 全体の一部
- ヒストグラム — 1つの変数の分布
- ボックスプロット — ばらつき、四分位数、外れ値
- ヒートマップ — 色別の値のマトリックス
- バイオリン図 — グループ別の分布密度
- レーダーチャート — 多変量プロファイル
- バブルチャート — 3つの変数を同時に
- エラーバーチャート — グループ平均値と標準偏差
- 相関行列 — ペアワイズ相関
- 積み上げ棒グラフ — グループ内の構成
- ウォーターフォールチャート — 累積加算と累積減算
- 2軸チャート — 2つのスケール上の棒グラフと線グラフ
- フォレスト・プロット — 効果推定値（95%信頼区間付き）
- カプラン・マイヤー曲線 — 時間の経過に伴う生存
- ROC曲線 — 分類器の性能（AUC）
- ブランド・アルトマンプロット — 方法の合意
- ファンネルチャート — 段階ごとの降車
- ツリーマップ — エリア別の入れ子構造の割合
- サンキーダイアグラム — ノード間のフロー
- ネットワーク図 — ノードと接続
- 箇条書き — 実績値と目標値の比較
どのグラフを使用すればよいですか？
2つのグループを比較する
ボックスプロット、バイオリンプロット、またはエラーバーチャートを使用してください。GraphProは自動的にウェルチt検定（正規分布に従わないデータの場合はマン・ホイットニー検定）を実行し、チャートの横に正確なp値を表示します。
3つ以上のグループを比較する
同じ3種類のグラフは、3つ目のグループが追加されると自動的に一元配置分散分析（またはクラスカル・ウォリス検定）に切り替わります。GraphProは、偽陽性率を高める補正なしのペアワイズ比較ではなく、意図的にこの包括的な検定結果を報告します。
2つの変数が関連しているかどうかを確認する
散布図を使用してください。GraphProはトレンドラインを当てはめ、ピアソン相関係数rまたはスピアマン相関係数ρとそのp値を報告するか、 2つ以上の変数に対する相関行列を同時に表示します。
グループ間でカテゴリやカウントを比較する
棒グラフまたは積み上げ棒グラフは、独立性のカイ二乗検定と組み合わせて使用しますが、棒グラフが実数を表す場合に限ります。棒グラフが平均値を表す場合は、箱ひげ図または誤差棒グラフを使用してください。
方法の一致度、生存率、または分類器の性能
GraphProは、メタアナリシスやシステマティックレビューのために、 Bland-Altmanプロット（バイアスと95%一致限界）、Kaplan-Meier曲線（時間経過に伴う生存率）、ROC曲線（AUC）、およびフォレストプロット（95%信頼区間付き効果推定値）も作成します。
編集可能なSVGエクスポートがあなたにとって何を意味するのか
GraphProで描画されるグラフはすべて、画像ではなく、編集可能な実際のベクターテキストと図形です。エクスポートしたSVGファイルをPowerPointに挿入し、右クリックして「グループ化」を選択し、さらに「グループ解除」を2回クリックします。すると、すべての棒グラフ、線、ラベルが個別に編集可能なPowerPointネイティブの図形になります。
同じファイルはInkscapeで直接開き、完全なベクター編集が可能です。フォントはジャーナルセーフなセット（Segoe UI、Arial、Helvetica、Times New Roman、Georgia）に限定されているため、元のフォントがインストールされていないコンピューターでも、エクスポートされた図は正しく表示されます。
この機能を動作させるために、サーバーにデータがアップロードされることはありません。解析、グラフのレンダリング、およびすべての統計テストは、ブラウザのタブ内でJavaScriptとして実行されます。そのため、GraphProはアカウントを必要とせず、データをどこにも保存しません。
よくある間違い
小サンプル連続データに棒グラフを使用する
703件の生理学論文を体系的にレビューした結果、多くの論文で連続データが棒グラフや折れ線グラフで提示されていることが判明した。しかし、実際には、さまざまな分布から同じ棒グラフの高さが得られる場合がある（Weissgerber et al., 2015）。箱ひげ図やバイオリンプロットは、実際のばらつきや外れ値を示す。
3つ以上のグループ間で個別のペアワイズt検定を実行する
すべてのペアを個別に比較すると、偽陽性率が高くなります。GraphProのボックスチャート、バイオリンチャート、エラーバーチャートは、まさにこの理由から、3つ目のグループが追加されると自動的に一元配置分散分析に切り替わります。
生のカウントではなく、パーセンテージや平均値にカイ二乗検定を適用する
独立性のカイ二乗検定では、各セルがカウントであることを前提としています。GraphProの棒グラフと積み上げ棒グラフでは、貼り付けた値がカウントではなく要約統計量のように見える場合、統計タブでその旨が直接表示されます。
小さな分割表で期待されるセル数が少ない場合を無視する
表の期待セル数の20%以上が5未満になると、カイ二乗近似は信頼できなくなります。GraphProはこれを警告として表示し、非常に小さなサンプルに対してはフィッシャーの正確確率検定がより適切な代替手段であることを示します。
2Dチャートの方が分かりやすいのに、3Dチャートに手を伸ばしてしまう
回転させた3D棒グラフや円グラフが実際にデータの伝達に役立つかどうかを判断する読者のために、学術論文における3Dグラフに関するガイド「効果的な場合と避けるべき場合」では、その判断について直接解説しています。また、GraphProは意図的に2D棒グラフ、散布図、箱ひげ図、バイオリングラフにこだわっており、3D効果によって生じる奥行き知覚の歪みなしに同じ比較を提示します。
よくある質問
Editverse GraphProは本当に無料ですか？
はい。登録は不要で、editverse.comの小さなクレジット以外に透かしも表示されず、作成できるチャートの数に制限もありません。
PowerPointにエクスポートした後でも、グラフを編集することはできますか？
はい。エクスポートされるのは画像ではなく、実際のSVGファイルです。PowerPointで2回グループ解除すると、各要素が個別に編集可能なネイティブシェイプに変換されます。
GraphProはSPSS、GraphPad Prism、またはRの代替となるものでしょうか？
いいえ。GraphProは、データを見ながら見やすい図を作成し、単一の有意性検定を行うという一般的な用途向けに設計されています。多変量モデル、混合効果モデル、または詳細な分析結果の記述が必要な場合は、統計パッケージを使用するか、Editverseの統計分析サービスをご利用ください。
どのグラフの種類にp値が組み込まれていますか？
散布図、箱ひげ図、バイオリン図、誤差棒グラフ、相関行列、棒グラフまたは積み上げ棒グラフ（カウントデータの場合は独立性のカイ二乗検定）。
参考情報
- ヴァイスガーバーTL、ミリッチNM、ウィンハムSJ、ガロビッチVD。 棒グラフや折れ線グラフを超えて：新たなデータ表現のパラダイムが必要な時が来た。 PLoS Biol。 2015; 13（4）：e1002128。 PMID 25901488。
- Streit M、Gehlenborg N。 棒グラフと箱ひげ図。 NATメソッド。 2014; 11（2）：117 PMID 24645191。
- タフテ E. 定量的情報の視覚的表示。 チェシャー、コネチカット州：グラフィックス・プレス；1983年。