تم النشر
قائمة STREGA هي دليل إرشادي لإعداد التقارير الخاصة بدراسات الارتباط الجيني. يرمز الاسم إلى "تعزيز الإبلاغ عن دراسات الارتباط الجيني"، وقد نشرها ليتل وزملاؤه عام 2009 كامتداد لبيان STROBE [1] . يتضمن STROBE 22 بندًا، وتضيف STREGA نصوصًا خاصة بعلم الوراثة إلى 12 بندًا منها [1] . تتناول هذه الإضافات مشكلات نادرة الحدوث في التصاميم الرصدية الأخرى، مثل خطأ تحديد النمط الجيني، والتفاوت بين المجموعات السكانية، وتوازن هاردي-واينبرغ، والعدد الكبير من المتغيرات التي يمكن اختبارها.
تكتفي معظم الأدلة بسرد العناصر، بينما يتجاوز هذا الدليل ذلك. فبعد قائمة التحقق نفسها، نُطبّق كل بند من بنود STREGA على دراسة حالة-مراقبة حقيقية متاحة للجميع، نُشرت في مجلة Hormones عام 2026، والتي تُشير إلى اتباعها لمنهجية STREGA، مع ذكر قسم المقالة بجانب كل نتيجة [2] . وقد وُثّقت الحاجة إلى ذلك. فقد فحص نيدوفيتش وزملاؤه 160 مجلة في علم الوراثة وعلم الوراثة، ووجدوا أن 29 مجلة فقط (18.1%) أشارت إلى STREGA في تعليماتها للمؤلفين، وأن الالتزام بقائمة التحقق كان أعلى بكثير في المجلات التي اعتمدتها [3].
بكلمات بسيطة
قائمة التحقق STREGA هي قائمة التحقق STROBE مع إضافة أسطر خاصة بعلم الوراثة. تحتفظ بجميع بنود STROBE الـ 22، وتضيف نصًا خاصًا بعلم الوراثة إلى 12 بندًا منها. تتناول هذه الأسطر الإضافية كيفية جمع الحمض النووي وتحديد النمط الجيني، وعدد العينات غير الصالحة، وما إذا كانت أعداد الأنماط الجينية تتوافق مع توازن هاردي-واينبرغ، وكيفية التعامل مع النسب، وعدد المتغيرات التي تم اختبارها، وما إذا كانت الدراسة تقريرًا أوليًا أم تكرارًا. أجب عن كل بند في جملة أو جملتين في قسم "الأساليب" أو "النتائج"، واذكر بوضوح متى لا ينطبق أي بند، وتأكد من تطابق جميع الأعداد في الملخص والجداول والنص.
ما هي قائمة التحقق الخاصة بـ STREGA وكيف ترتبط بـ STROBE
يُعدّ STREGA النظير الجيني لإرشادات STROBE للدراسات الرصدية، والتي يشرحها دليل STROBE الخاص بنا بالتفصيل. وقد قام فريق متعدد التخصصات بتطويره استنادًا إلى مراجعة الأدبيات، وعروض ورش العمل، والمناقشات، والمراسلات الإلكترونية المتكررة. حضر 33 مدعوًا من أصل 74 ورشة عمل في أوتاوا في يونيو 2006، وكان من بينهم علماء أوبئة، وعلماء وراثة، وإحصائيون، ومحررو مجلات، وطلاب دراسات عليا [1] . نُشر البيان في عام 2009 في العديد من المجلات، وصدرت نسخة PLoS Medicine بموجب ترخيص Creative Commons CC0، مما يسمح بإعادة استخدام صياغته بحرية [1].
يؤكد المؤلفون أن توصياتهم لا تهدف إلى تأييد أو معارضة أي تصميم أو منهجية دراسة محددة، بل إلى الشفافية والشمولية في عرض نتائج الدراسة [1] . ولذلك، تسجل قائمة التحقق هذه ما إذا كان بإمكان القارئ العثور على المعلومات المطلوبة، ولا تُقيّم جودة الدراسة. وقد برزت فجوة الإبلاغ التي تستهدفها هذه القائمة مبكرًا. ويستشهد المؤلفون بتقييم عينة عشوائية من 315 دراسة ارتباط جيني نُشرت بين عامي 2001 و2003، حيث لم تصف سوى بعض الدراسات طرق التحقق من صحة التنميط الجيني [1].
بنود قائمة مراجعة ستريجا حسب قسم المخطوطة
يُعيد الجدول 1 صياغة البنود الـ 22 ويُبيّن ما يُضيفه برنامج STREGA إلى كل بند، مُصنّفًا حسب قسم المخطوطة الذي ينتمي إليه الجواب. الصياغة من وضعنا، والنص الأصلي موجود في الجدول 1 من الورقة البحثية المتاحة للجميع [1] . بحسب إحصائنا، يبلغ عدد الإضافات 18 سطرًا إضافيًا أو مُوسّعًا موزعة على 12 بندًا، مع تركيز أكبر على البند 12، وهو الأساليب الإحصائية.
الجدول 1. عناصر STROBE الـ 22 وإضافات STREGA، معاد صياغتها من Little et al.، 2009 (CC0).
| العناصر | الموضوع | الطلب الأساسي، بتصرف | إضافة ستريجا، بتصرف |
|---|---|---|---|
| 1 | العنوان والملخص | قم بتسمية التصميم بمصطلح شائع في العنوان أو الملخص، وقدم ملخصًا إعلاميًا ومتوازنًا. | بدون سلوفان |
| 2 | الخلفية والمنطق | اشرح الخلفية العلمية والأساس المنطقي. | لا شيء (يُطلب توضيح الأساس المنطقي للجينات والمتغيرات المختارة في البند 7) |
| 3 | الأهداف | أهداف خاصة بكل ولاية، بما في ذلك أي فرضيات محددة مسبقًا. | حدد ما إذا كانت الدراسة تقريراً أولياً عن وجود ارتباط، أو تكراراً للدراسة، أو كليهما. |
| 4 | تصميم الدراسة | اعرض العناصر الأساسية للتصميم مبكراً. | بدون سلوفان |
| 5 | الضبط | حدد المكان والمواقع والتواريخ ذات الصلة. | بدون سلوفان |
| 6 | المشاركون | حدد معايير الأهلية والمصادر وطرق الاختيار وتفاصيل المطابقة للدراسات المتطابقة. | صف كيف تم اختيار المجموعات الفرعية عندما يأتي المشاركون من دراسة أكبر. |
| 7 | المتغيرات | حدد النتائج، والتعرضات، والمتنبئات، والعوامل المربكة، ومعدلات التأثير. | حدد المتغيرات الجينية باستخدام تسمية شائعة الاستخدام، وقم بتسمية المتغيرات التي من المحتمل أن ترتبط بالتصنيف السكاني. |
| 8 | مصادر البيانات والقياس | اذكر مصادر وأساليب التقييم لكل متغير، ومدى قابليتها للمقارنة بين المجموعات. | صف العمل المخبري، بما في ذلك مصدر الحمض النووي وتخزينه، وطريقة ومنصة تحديد النمط الجيني، وخوارزمية الاستدعاء وإصدارها، ومعدلات الخطأ والاستدعاء، والمختبر، وقابلية المقارنة، وما إذا تم تعيين الأنماط الجينية معًا أو على دفعات. |
| 9 | انحياز | صف الجهود المبذولة لمعالجة المصادر المحتملة للتحيز. | بالنسبة للنتائج الكمية، اذكر ما إذا تم فحص التحيز الناتج عن العلاج الدوائي وكيف تم التعامل معه. |
| 10 | حجم الدراسة | اشرح كيف تم تحديد حجم الدراسة. | بدون سلوفان |
| 11 | المتغيرات الكمية | اشرح كيف تم التعامل مع المتغيرات الكمية وتجميعها. | اذكر كيف تم التعامل مع آثار العلاج، إن وجدت. |
| 12 | الأساليب الإحصائية | صف جميع الأساليب، وتحليلات المجموعات الفرعية والتفاعلات، والبيانات المفقودة، ومعالجة المطابقة أو المتابعة، وتحليلات الحساسية. | حدد إصدار البرنامج والإعدادات. أضف توازن هاردي-واينبرغ (12f)، واستنتاج الأنماط الجينية أو الأنماط الفردية (12g)، والتصنيف السكاني (12h)، والمقارنات المتعددة (12i) والقرابة (12j). |
| 13 | المشاركون (النتائج) | قم بالإبلاغ عن الأرقام في كل مرحلة، وأسباب عدم المشاركة، وخذ في الاعتبار مخطط التدفق. | قم بالإبلاغ عن عدد الأفراد الذين خضعوا لمحاولة تحديد النمط الجيني وعدد الذين نجحوا في ذلك. |
| 14 | بيانات وصفية | اذكر خصائص المشاركين، وعدد البيانات المفقودة، ومدة المتابعة للمجموعات. | ضع في اعتبارك تقديم المعلومات حسب النمط الجيني. |
| 15 | بيانات النتائج | قم بالإبلاغ عن نتائج الأحداث أو فئات التعرض حسب نوع الدراسة. | قم بالإبلاغ عن النتائج أو الأرقام حسب فئة النمط الجيني. |
| 16 | نتائج رئيسية | قدم تقديرات غير معدلة ومعدلة بدقة، وحدود الفئات، والمخاطر المطلقة إن وجدت. | أضف نتائج أي تعديل للمقارنات المتعددة (16د). |
| 17 | تحليلات أخرى | قم بالإبلاغ عن تحليلات أخرى مثل المجموعات الفرعية وتحليلات الحساسية. | لخص النتائج من جميع المتغيرات التي تم فحصها (17ب)، واذكر أين يمكن الوصول إلى النتائج التفصيلية (17ج). |
| 18 | النتائج الرئيسية | لخص النتائج الرئيسية في ضوء الأهداف. | بدون سلوفان |
| 19 | القيود | ناقش القيود، مع تحديد اتجاه وحجم أي تحيز. | بدون سلوفان |
| 20 | التفسير | أعطِ تفسيراً عاماً حذراً. | بدون سلوفان |
| 21 | التعميم | ناقش الصلاحية الخارجية. | بدون سلوفان |
| 22 | التمويل: | اذكر مصدر التمويل ودور الجهات الممولة. | بدون سلوفان |
يوضح الشكل 1 نفس البنية بإيجاز. تحتوي 12 خانة من أصل 22 على إضافة متعلقة بعلم الوراثة، وتتجمع هذه الخانات في قسمي "الأساليب" و"النتائج"، حيث توجد معلومات المختبر والإحصاءات وعدد المشاركين. أما بنود "المقدمة" و"المناقشة"، باستثناء البند 3، فتحتفظ بصياغتها الخاصة وفقًا لمعايير STROBE.

المشاكل الوراثية الخمس التي تستهدفها شركة ستريجا
يُحدد مؤلفو مشروع STREGA خمسة مجالات ذات أهمية خاصة، أو ذات صلة وثيقة بدراسات الارتباط الجيني [1] . يوضح الجدول 2 كل مجال منها مع العنصر الذي يتناوله وسبب أهميته.
الجدول 2. المجالات الخمسة الرئيسية ذات الأهمية الخاصة في STREGA، معاد صياغتها من Little et al.، 2009.
| المساحة | لماذا يهم | المنتجات | ماذا تبلغ |
|---|---|---|---|
| أخطاء التنميط الجيني | عادةً ما تؤدي الأخطاء غير التفاضلية إلى تحيز الارتباطات نحو العدم. ويمكن أن تؤدي الاختلافات المنهجية في تحديد النمط الجيني حسب حالة النتيجة إلى تحيز النتائج في أي اتجاه. | 8 ب ، 13 أ | صف العمل المخبري واذكر عدد محاولات تحديد النمط الجيني وعدد المحاولات الناجحة. |
| التقسيم الطبقي للسكان | يحدث التداخل عندما تختلف المجموعات الفرعية في ترددات الأليلات وفي خطر الإصابة بالأمراض، وتكون موزعة بشكل غير متساوٍ عبر المجموعات التي تتم مقارنتها. | 7ب، 12ح | قم بالإبلاغ عن معلومات العرق والأساليب المستخدمة لتقييم أو معالجة التفاوت الطبقي، أو اذكر أنه لم يتم استخدام أي منها. |
| تنوع النمط الفرداني | عادةً ما يتعين استنتاج الأنماط الفردية، وتختلف الطرق المستخدمة في ذلك. | 12 غرام | صف كيف تم استنتاج الأنماط الجينية أو الأنماط الفردية، بما في ذلك عدم اليقين والأنماط الفردية النادرة والبرمجيات. |
| توازن هاردي-واينبرغ | قد يشير الخروج عن حالة التوازن إلى أخطاء في تحديد النمط الجيني أو إلى خصائص غير مألوفة في البيانات. في تحليل شمل ما يقرب من 600 دراسة، اختلفت نتائج الدراسات التي خالفت النموذج اختلافًا كبيرًا عن تلك التي توافقت معه في خمس من أصل 42 ارتباطًا بين الجينات والأمراض. | 12f | حدد ما إذا تم أخذ التوازن في الاعتبار وكيف، وبالنسبة للمنصات الكبيرة، اذكر أي عتبة تم استخدامها لاستبعاد المتغيرات. |
| النسخ المتماثل | تتزايد التقارير التي تعرض وتجمع عدة دراسات في ورقة بحثية واحدة. | 3 | حدد ما إذا كانت الدراسة تقريرًا أوليًا، أو تكرارًا، أو كليهما، وقم بتوثيق معايير الادعاء بالتكرار. |
يذكر المؤلفون سبع قضايا أخرى، وهي: اختيار المشاركين، والأساس المنطقي لاختيار الجينات والمتغيرات، وتأثيرات العلاج في دراسات الصفات الكمية، والأساليب الإحصائية، والقرابة، والإبلاغ عن البيانات الوصفية وبيانات النتائج، وحجم البيانات المختبرة [1] . وتُعدّ الأخيرة منها بالغة الأهمية في الدراسات الجينومية الشاملة، حيث يُتوقع أن يُسفر البحث في مئات الآلاف من المتغيرات عن العديد من نسب الاحتمالات الإيجابية الكاذبة بالصدفة وحدها. ويُغطي دليلنا للأساليب الإحصائية في علم الجينوم جانب الاختبار، ويُبيّن دليلنا لاختبار مربع كاي الاختبار الذي يُقارن عدد الأنماط الجينية ويتحقق من انحرافات التوازن.
الاختيار بين قائمة التحقق STREGA و STROBE و STROBE-MR
استخدم قائمة مراجعة STREGA عندما تُشير الورقة البحثية إلى وجود ارتباط بين متغير جيني وسمة أو مرض في تصميم دراسة أترابية أو دراسة حالة-مراقبة أو دراسة مقطعية، سواءً تم اختيار المتغيرات كمرشحة أو تم مسحها على مستوى الجينوم. يتضمن جدول STREGA مصطلحات STROBE، لذا فإن جدولًا واحدًا مكتملًا يُغطي كلا النوعين. تختلف ورقة بحثية حول التوزيع العشوائي المندلي، لأنها تُعامل المتغيرات الجينية كأدوات لتقدير التأثير السببي، ولها دليلها الإرشادي الخاص المكون من 20 بندًا، STROBE-MR [5] . يُقيّم مثالنا العملي لـ STROBE-MR دراسة حقيقية بندًا بندًا بنفس طريقة هذا الدليل.
بالنسبة للمنهجية نفسها، ابدأ بشرحنا حول التوزيع العشوائي المندلي ، ثم اقرأ كيف يُشير إحصاء F إلى ضعف المتغيرات المساعدة، وما يحمي منه كل مُقدِّر من المُقدِّرات الأربعة في دليلنا حول تعدد التأثيرات الجينية ، ولماذا غالبًا ما يُحسم رفض الدراسة بناءً على حساب القدرة الإحصائية . إذا لم تكن متأكدًا من الدليل الإرشادي الأنسب لتصميمك، فاستخدم التصميم المذكور في العنوان كدليل، مع استخدام STREGA لدراسات الارتباط الجيني وSTROBE-MR للتوزيع العشوائي المندلي. قد يُقيِّم المُراجعون الذين يجمعون دراسات الارتباط الجيني أيضًا دراسات الحالات والشواهد باستخدام مقياس نيوكاسل-أوتاوا، وهو أداة لتقييم الجودة وليس دليلًا إرشاديًا لإعداد التقارير، لذا فإن كليهما يُجيب على أسئلة مختلفة.
مثال الوصول المفتوح الذي حققنا فيه نقاطًا
المقال الذي قمنا بتقييمه
اخترنا دراسة كاليسيس وزملائه، المنشورة في مجلة Hormones عام 2026، والتي تتناول الخلفية الجينية للسمنة في دراسة حالة-مراقبة [2] . استُلمت الورقة البحثية في 7 أكتوبر 2025، وقُبلت في 24 أبريل 2026، ونُشرت إلكترونيًا في 2 يونيو 2026. ينص ملخص الدراسة على أن "الدراسة أُجريت وكُتب تقريرها وفقًا لإرشادات STREGA"، وتستشهد المقالة بدراسة ليتل وزملائه كمرجع لهذه الإرشادات. تقارن الدراسة 257 بالغًا يونانيًا مصابًا بالسمنة، 136 منهم غير مصابين بداء السكري من النوع الثاني، و121 مصابين به، وذلك في ثلاثة متغيرات جينية: TCF7L2 rs7903146، وFTO rs9939609، وPPARG rs1801282، كما تُضيف تحليلًا لمستوى الهيموجلوبين السكري (HbA1c) ضمن المجموعة غير المصابة بالسكري.
الترخيص هو CC BY 4.0، وتتفق ثلاثة سجلات مستقلة على ذلك. يُشير سجل ترخيص Crossref للنسخة المُعتمدة إلى رابط Creative Commons Attribution 4.0 بتاريخ بدء 2 يونيو 2026، ويُشير حقل ترخيص Europe PMC إلى "cc by"، ويُشير بيان الترخيص داخل ملف XML الخاص بالمقالة (JATS) إلى ترخيص Creative Commons Attribution 4.0 الدولي. كما يُدرج سجل بيانات PMC المفتوحة الترخيص على أنه CC BY وأن المقالة لم تُسحب. ولأن نسخة PMC قد تختلف عن نسخة الناشر، قارنّا نص XML مع ملف PDF المُنسّق الموجود في حاوية بيانات PMC المفتوحة، والذي يحمل تصميم المجلة وأرقام الصفحات من 527 إلى 533، ولم نجد أي اختلافات في صياغة أقسام المنهجية والنتائج والمناقشة. تُشير روابط الصفحات أدناه إلى ملف PDF هذا.
لم نجد قائمة مراجعة STREGA مكتملة ضمن ملفات المقالة، وهي النص والشكل وملف XML وملف PDF. الشكل الوحيد الموجود هو مخطط غابة لنسب الاحتمالات، لذا لم نقم بإعادة نشر أي شكل، وتم تلخيص الجداول بأسلوبنا الخاص.
كيف قمنا بتقييمها؟
يحتوي جدول STREGA على 22 عنصرًا، والعديد منها يتضمن أجزاءً مرقمة، لذا قمنا بتقييم 49 صفًا، كل منها مصحوب برقم قسم المقالة أو الصفحة. يتم وسم الصفوف التي يضيفها STREGA إلى STROBE. يحمل كل صف أحد خمسة تقييمات. " مُبلغ عنه" يعني أن المعلومات موجودة وواضحة. " مُبلغ عنه جزئيًا" يعني أن بعض المعلومات موجودة، أو أنها موجودة ولكنها غير متسقة. " غير مُبلغ عنه" يعني أننا لم نجد شيئًا. " غير قابل للتطبيق" يعني أن الصف لا يتناسب مع التصميم، ونوضح السبب. " تقدير شخصي" يعني أن القراء العاديين يمكنهم تقييم الصف بأي من الطريقتين، ونشرح تفسيرنا.
يجب مراعاة أمرين. أولاً، STREGA هي دليل إرشادي لإعداد التقارير، لذا فإنّ السطر الذي يحمل علامة "غير مُبلغ عنه" يعني أننا لم نتمكن من العثور على المعلومات في المقالة، وقد يحتفظ بها المؤلفون في مكان آخر. ثانياً، نُقيّم فقط ما ورد في المقالة المنشورة. الاقتباسات حرفية، ولا تتجاوز 25 كلمة، ويتم التحقق منها بمقارنتها مع ملف PDF المُنسّق.
قائمة مراجعة ستريجا المطبقة على المثال، بندًا بندًا
الجدول 3. تطبيق برنامج STREGA على دراسة كاليسيس وآخرون، مجلة الهرمونات 2026 (CC BY 4.0). تشير أرقام الصفحات ومراجع الجداول في العمود الثالث إلى المقالة المنشورة في مجلة الهرمونات 2026، المجلد 25، العدد 2، الصفحات من 527 إلى 533.
| العنصر والصف | ما ورد في المقال | أين تجده | حكم |
|---|---|---|---|
| 1أ- تصميم مذكور في العنوان أو الملخص | ينتهي العنوان بعبارة "دراسة حالة وضابطة" ويبدأ ملخص الأساليب بعبارة "في دراسة الحالة والضابطة هذه". | العنوان؛ الملخص، ص 527 | وذكرت |
| 1ب ملخص إعلامي ومتوازن | يقدم الملخص العينة (257 بالغًا، 136 بدون و 121 مصابًا بداء السكري من النوع 2)، والمتغيرات الثلاثة، وخطة التحليل، ونسب الأرجحية مع فاصل الثقة 95٪، وتحذيرين، وهما النماذج غير المعدلة وانحرافات هاردي-واينبرغ في الضوابط. | الملخص، ص 527 | وذكرت |
| 2. الخلفية والأساس المنطقي | تستعرض المقدمة علم الوراثة لمرض السكري من النوع الثاني، والنتائج على مستوى الجينوم، والأدلة السابقة لـ TCF7L2 rs7903146، وFTO rs9939609، وPPARG rs1801282. | مقدمة، ص 528 | وذكرت |
| 3أ- أهداف محددة وفرضيات محددة مسبقًا | الهدف الرئيسي هو مقارنة تواتر المتغيرات الثلاثة بين البالغين المصابين بالسمنة، سواء كانوا مصابين بداء السكري من النوع الثاني أم لا، بينما يغطي هدف ثانوي مستوى الهيموجلوبين السكري (HbA1c) لدى المجموعة غير المصابة بالسكري. يُطلق على النموذج الإضافي اسم "النموذج المحدد مسبقًا"، لكن المقالة لا تذكر أي بروتوكول أو تسجيل. | المقدمة، الفقرة الأخيرة؛ التحليل الإحصائي، الصفحات من 528 إلى 529 | وذكرت |
| 3ب- التقرير الأول، أو التكرار، أو كليهما إضافة ستريجا | لا يوضح المقال ما إذا كان هذا التقرير أول دراسة أم تكرارًا لنتائج سابقة. ويشير قسم المناقشة إلى أن الأدلة المستقاة من السكان اليونانيين محدودة، مما يوحي بتكرار مواقع جينية معروفة في مجموعة سكانية جديدة، إلا أن هذه النقطة تبقى ضمنية. | المناقشة، الفقرة الأخيرة، صفحة 532 | قرارٌ يُتخذ بناءً على تقدير. |
| 4 عناصر تصميم رئيسية في وقت مبكر | تم ذكر تصميم دراسة الحالات والشواهد في العنوان، والملخص، ونهاية المقدمة، والجملة الأولى من قسم الطرق. | العنوان؛ المقدمة، صفحة 528؛ مجتمع الدراسة، صفحة 528 | وذكرت |
| 5. الإعداد والمواقع والتواريخ | استمر التوظيف من 20 مايو 2023 إلى 20 مايو 2024، وتم تحديد تاريخ الموافقة الأخلاقية، واسم مختبر تحديد النمط الجيني. ذُكرت مواقع التوظيف دون تحديد أسمائها، ولم يتم تحديد مختبرات قياس مستوى الهيموجلوبين السكري (HbA1c). | مجموعة الدراسة؛ التقييم السريري، الصفحات من 528 إلى 529 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 6أ- الأهلية، ومصادر واختيار الحالات والضوابط | الحالات هي بالغون لديهم مؤشر كتلة جسم أعلى من 30 ومصابون بداء السكري من النوع الثاني، أما المجموعة الضابطة فهي بالغون يعانون من السمنة ولا يعانون من داء السكري، وقد تم استبعاد المصابين بداء السكري أحادي الجين أو الأمراض المصاحبة الشديدة. لم توضح المقالة كيفية تشخيص داء السكري، أو كيفية التواصل مع المشاركين، أو سبب اختيار هذه المجموعة الضابطة. | مجتمع الدراسة، ص 528 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 6أ- اختيار مجموعات فرعية من دراسة أكبر إضافة ستريجا | لم توضح المقالة ما إذا كان هؤلاء المشاركون ينتمون إلى دراسة أوسع. وقد ذُكرت "مجموعة بيانات تحليلية مجهولة الهوية" دون تحديد مصدرها، لذا يمكن تفسير هذا السطر على أنه غير قابل للتطبيق أو على أنه ثغرة. | التقييم السريري، صفحة 528 | قرارٌ يُتخذ بناءً على تقدير. |
| 6ب معايير المطابقة لدراسة متطابقة | لم يتم وصف أي تطابق، ويختلف متوسط الأعمار بأربع سنوات (50 و 54)، وهو ما يتناسب مع تصميم غير متطابق. | مجتمع الدراسة؛ الجدول 1، الصفحات من 528 إلى 529 | غير قابل للتطبيق |
| 7أ- تعريفات النتائج والتعرضات والعوامل المربكة | تم تحديد السمنة (مؤشر كتلة الجسم أعلى من 30)، وحالة الإصابة بداء السكري، وفئات الهيموجلوبين السكري (عتبات الجمعية الأمريكية للسكري). لم تُذكر أي معايير تشخيصية لداء السكري، وتم ذكر العمر والجنس ومؤشر كتلة الجسم كمتغيرات مشتركة، لكنها لم تُدرج في النموذج. | مجموعة الدراسة؛ التقييم السريري، الصفحات من 528 إلى 529 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 7ب. التعرضات الجينية في تسمية قياسية إضافة ستريجا | يتم تسمية كل متغير بواسطة الجين ورقم rs، مع تسميات النمط الجيني مثل CC وCT وTT لـ TCF7L2 rs7903146. | التقييم السريري، صفحة 529؛ الجداول من 2 إلى 4 | وذكرت |
| 7ب- المتغيرات المرتبطة بالتفاوت الطبقي للسكان إضافة ستريجا | يذكر المقال أن "جميع المشاركين كانوا من أصل قوقازي يوناني وفقًا لسجل الدراسة". لم يتم وصف كيفية تسجيل الأصل، ولم يتم الإبلاغ عن أي علامات أو متغيرات متعلقة بالأصل. | مجتمع الدراسة، ص 528 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 8أ- مصادر وقياس كل متغير | استُقيت البيانات السريرية من التقييم الروتيني في مواقع التجنيد. قُيس مستوى الهيموجلوبين السكري (HbA1c) باستخدام كروماتوغرافيا السائل عالي الأداء في مختبرات سريرية معتمدة اختارها المشاركون، ولم يُذكر مدى قابلية المقارنة بين هذه المختبرات. تشير القيود إلى التباين بين المختبرات. | التقييم السريري، الصفحات 528 إلى 529؛ القيود، الصفحة 532 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 8ب- أساليب المختبر والتنميط الجيني إضافة ستريجا | تم استخلاص الحمض النووي من الدم الكامل، واستُخدمت تقنية تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي (PCR) على نظام rhAmp SNP Genotyping في مختبر معتمد مُحدد، ويذكر المقال أن "جميع الاختبارات الثلاثة حققت معدل استدعاء بنسبة 100%، وأظهرت عملية تحديد النمط الجيني المكررة تطابقًا بنسبة 100%". لم يُذكر تخزين الحمض النووي، أو برنامج الاستدعاء وإصداره، أو تخصيص الدفعة، أو ما إذا تم تحديد النمط الجيني للحالات والضوابط في ظل ظروف متطابقة. | التقييم السريري، صفحة 529 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 9أ- الجهود المبذولة لمعالجة التحيز | تم وصف إجراءات ضبط الجودة (معدل الاستدعاء، والتكرار الجيني، واختبار هاردي-واينبرغ في عينات الضبط) وعينة من أصل واحد. لم يتم التطرق إلى أي جهد مبذول لمكافحة تحيز الاختيار أو العوامل المربكة، وتتضمن قائمة القيود تحيز الاختيار وتحيز البقاء. | التقييم السريري، صفحة 529؛ القيود، صفحة 532 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 9ب و11 تأثيرات المعالجة على الصفات الكمية إضافة ستريجا | لم توضح المقالة ما إذا كان العلاج الخافض لسكر الدم قد أثر على مستوى الهيموجلوبين السكري (HbA1c). يُحلل مستوى الهيموجلوبين السكري فقط لدى الأفراد غير المصابين بالسكري، ويُصنف ضمن فئتين فقط، لذا قد لا يكون لهذا البند أهمية كبيرة هنا، ويمكن للقراء تقييمه بأي شكل من الأشكال. | التقييم السريري، صفحة 529 | قرارٌ يُتخذ بناءً على تقدير. |
| 10- كيف تم تحديد حجم الدراسة | لم يُقدّم أي تفسير أو حساب لحجم العينة لـ ٢٥٧ مشاركًا. وتصف القيود حجم العينة بأنه متواضع. | غير موجود؛ القيود، ص 532 | لم يبلغ عنها |
| 11- التعامل مع المتغيرات الكمية | يتم إعطاء العمر كمتوسط مع نطاق، ويتم تجميع HbA1c عند حدود ADA (نسبة السكر الطبيعية في الدم من 4.0 إلى 5.6، ومرحلة ما قبل السكري من 5.7 إلى 6.4)، ويتم ترميز النمط الجيني بشكل إضافي لكل أليل خطر. | التقييم السريري؛ التحليل الإحصائي، ص 529 | وذكرت |
| 12أ- الأساليب الإحصائية وإصدار البرنامج إضافة ستريجا | تمت مقارنة توزيعات الأنماط الجينية باستخدام اختبار مربع كاي، واستُخدم الانحدار اللوجستي غير المشروط مع نموذج أولي إضافي ونماذج ثانوية سائدة ومتنحية، جميعها غير معدلة للسبب المذكور. تشير المقالة إلى استخدام برنامج IBM SPSS Statistics الإصدار 26. لم يُذكر اسم الأداة المستخدمة لإجراء اختبار هاردي-واينبرغ الدقيق. | التحليل الإحصائي، ص 529 | وذكرت |
| 12ب المجموعات الفرعية والتفاعلات | التحليل الفرعي الوحيد هو تحليل النمط الجيني حسب فئة HbA1c ضمن مجموعة الضبط، وقد تم وصفه. لم يتم ذكر أي تحليل للتفاعلات. | التحليل الإحصائي، ص 529 | وذكرت |
| 12c بيانات مفقودة | تم توضيح اكتمال النمط الجيني، وتم شرح غياب بيانات العمر والجنس ومؤشر كتلة الجسم على مستوى المشاركين بالتفصيل. ولم يتم توضيح كيفية التعامل مع قيم الهيموجلوبين السكري المفقودة. | التحليل الإحصائي؛ النتائج، صفحة 529 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 12- استراتيجية المطابقة أو أخذ العينات في التحليل | غير قابل للتطبيق لعدم وجود وصف للمطابقة. | غير قابل للتطبيق | غير قابل للتطبيق |
| تحليلات الحساسية 12e | تُطبَّق النماذج السائدة والمتنحية جنبًا إلى جنب مع النموذج الجمعي، ولكن لا يوجد تحليل لاختبار كيفية تأثير انحرافات هاردي-واينبرغ على النتائج. قد يعتبر بعض القراء مقارنة النموذج الجيني بمثابة تحليل حساسية. | التحليل الإحصائي، صفحة 529؛ الجدول 4، صفحة 530 | قرارٌ يُتخذ بناءً على تقدير. |
| توازن هاردي-واينبرغ 12f إضافة ستريجا | تم اختبار التوازن في عينات الضبط باستخدام اختبار دقيق ومرجع، ويُبين الجدول 2 الأفراد غير المتجانسين الملاحظين والمتوقعين. تنصّ طرق البحث على أنه "تم تقييم توازن هاردي-واينبرغ باستخدام اختبار دقيق"، ولم يُذكر أي حدّ للاستبعاد، لأن جميع المتغيرات الثلاثة تم الاحتفاظ بها. | التقييم السريري، صفحة 529؛ الجدول 2، صفحة 529 | وذكرت |
| 12 غرام: استنتاج الأنماط الجينية أو الأنماط الفردية إضافة ستريجا | تم تحديد النمط الفردي مباشرة بواسطة تفاعل البوليميراز المتسلسل في الوقت الحقيقي ولم يتم وصف أي تحليل للنمط الفرداني، لذلك لا ينطبق هذا السطر. | التقييم السريري، صفحة 529 | غير قابل للتطبيق |
| 12 ساعة: التفاوت الطبقي للسكان إضافة ستريجا | يقتصر التحليل على الأصول القوقازية اليونانية، وهو المقياس الوحيد المذكور. تشير المناقشة إلى المكونات الرئيسية كنهج معياري، وإلى تحليل المعلومات المتعلقة بالأصول كعمل مستقبلي، لكن المقال لا يذكر صراحةً عدم تطبيق أيٍّ منهما. | مجتمع الدراسة، صفحة 528؛ المناقشة، صفحة 531 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 12i المقارنات المتعددة والنتائج الإيجابية الخاطئة إضافة ستريجا | تم اختبار ثلاثة متغيرات وثلاثة نماذج وراثية عند مستوى 0.05، ولم تقدم المقالة أي تصحيح أو سبب لعدم وجود أي تصحيح. | التحليل الإحصائي، ص 529 | لم يبلغ عنها |
| 12j العلاقة بين المواضيع إضافة ستريجا | لم يذكر المقال ما إذا كان المشاركون غير مرتبطين ببعضهم البعض. | لم يتم العثور على | لم يبلغ عنها |
| 13أ- الأعداد في كل مرحلة من مراحل الدراسة | يذكر المقال 257 مشاركاً (136 من المجموعة الضابطة، و121 من المجموعة المصابة). ولم يُذكر عدد الأشخاص الذين تم التواصل معهم، أو الذين تم تقييم أهليتهم، أو الذين تم استبعادهم وفقاً لمعايير الاستبعاد المحددة. | مجتمع الدراسة، ص 528 | تم الإبلاغ جزئياً |
| تمت محاولة تحديد النمط الجيني 13أ بنجاح إضافة ستريجا | يذكر المقال أن "جميع المشاركين الـ 257 تم تحديد النمط الجيني لهم بنجاح لجميع المواقع الثلاثة". | النتائج، صفحة 529 | وذكرت |
| 13ب أسباب عدم المشاركة | لم يتم ذكر أي أسباب أو إحصاءات. | لم يتم العثور على | لم يبلغ عنها |
| مخطط التدفق 13c | لا يوجد مخطط انسيابي. يشير البند إلى ضرورة النظر في إنشاء واحد، ويتطلب المخطط أولاً عدد المراحل المفقودة من الصف 13أ. | لم يتم العثور على | قرارٌ يُتخذ بناءً على تقدير. |
| 14أ- خصائص المشاركين، مع معلومات النمط الجيني إضافة ستريجا | يُبيّن الجدول 1 العمر (المتوسط والمدى)، وعدد الجنس، ومتوسط مؤشر كتلة الجسم، ومستوى الهيموجلوبين السكري (المتوسط والانحراف المعياري) حسب المجموعة، دون وجود نطاق لمؤشر كتلة الجسم. ولا يوجد جدول للخصائص حسب النمط الجيني. | الجدول 1، صفحة 529 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 14ب- البيانات المفقودة لكل متغير | يذكر المقال أن بيانات العمر والجنس ومؤشر كتلة الجسم على مستوى المشاركين لم تكن متاحة، كما أنه لا يقدم أي إحصاءات عن قيم HbA1c المفقودة. | التقييم السريري، الصفحات من 528 إلى 529 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 14 ج وقت المتابعة | غير قابل للتطبيق لأن الدراسة ليست دراسة جماعية. | غير قابل للتطبيق | غير قابل للتطبيق |
| 15 رقمًا في كل فئة من فئات النمط الجيني (دراسة الحالات والشواهد) إضافة ستريجا | يُبيّن الجدول 3 عدد ونسبة كل نمط جيني في مجموعتي الضوابط والحالات. ويبلغ مجموع العمودين 136 و121 في حساباتنا، وذلك لجميع المتغيرات الثلاثة. | الجدول 3، صفحة 530 | وذكرت |
| 16أ- التقديرات غير المعدلة والمعدلة بدقة | يُبيّن الجدول 4 نسب الأرجحية غير المُعدّلة مع فترات الثقة 95% لثلاثة نماذج في كل متغير، دون أي تقديرات مُعدّلة، مع ذكر السبب. ولأن متوسط الأعمار يختلف بأربع سنوات، فقد يرغب بعض القراء في الحصول على تقديرات مُعدّلة، بينما يتقبّل آخرون التفسير. | الجدول 4، صفحة 530؛ المناقشة، صفحة 532 | قرارٌ يُتخذ بناءً على تقدير. |
| 16ب حدود الفئات للمتغيرات المستمرة | تم تحديد حدود HbA1c (أقل من 5.7، ومن 5.7 إلى 6.4). | التقييم السريري، صفحة 529؛ الجدول 5، صفحة 531 | وذكرت |
| 16 ج خطر مطلق | غير قابل للتطبيق. لا تُنتج عينة دراسة الحالات والشواهد ذات أحجام المجموعات الثابتة مخاطر مطلقة بدون بيانات حدوث خارجية. | غير قابل للتطبيق | غير قابل للتطبيق |
| 16د نتائج التعديلات الخاصة بالمقارنات المتعددة إضافة ستريجا | لم يتم الإبلاغ عن أي منها، وهو ما يتبع من الصف 12i. | لم يتم العثور على | لم يبلغ عنها |
| 17أ تحليلات أخرى | تم الإبلاغ عن النماذج السائدة والمتنحية (الجدول 4) وتحليل HbA1c (الجدول 5). | الجدولان 4 و 5، الصفحات من 530 إلى 531 | وذكرت |
| 17ب ملخص نتائج جميع المتغيرات التي تم فحصها إضافة ستريجا | تم تحليل ثلاثة متغيرات فقط، وجميعها تظهر مع كل نموذج في الجداول من 2 إلى 5. | الجداول من 2 إلى 5، الصفحات من 529 إلى 531 | وذكرت |
| 17ج حيث يمكن الوصول إلى النتائج التفصيلية إضافة ستريجا | غير قابل للتطبيق لأن المقالة لا تشير إلى نتائج موجودة في مكان آخر، وجداولها تتضمن كل النتائج. | غير قابل للتطبيق | غير قابل للتطبيق |
| 18 نتيجة رئيسية مقارنة بالأهداف | تعيد فقرة المناقشة الأولى التأكيد على الارتباطات في جميع المواقع الثلاثة وتصنف TCF7L2 rs7903146 على أنه أقوى إشارة. | المناقشة، ص 530 | وذكرت |
| 19- القيود، مع تحديد اتجاه وحجم التحيز | تم سرد خمسة قيود، بما في ذلك النماذج غير المعدلة، وعينة صغيرة، وانحرافات هاردي-واينبرغ في جميع المواقع الثلاثة. لم يحدد أي منها اتجاه أو مقدار التحيز المحتمل في التقديرات. | القيود، ص 532 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 20 تفسير عام حذر | وُصفت النتائج بأنها "مفيدة ومولدة للفرضيات"، وتمت مقارنة نتائج PPARG مع التحليل التلوي HuGE، كما تم تقييم نتائج هاردي-واينبرغ. ولم يتم التطرق إلى تعدد التحليلات. | المناقشة، الصفحات من 530 إلى 532 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 21 قابلية التعميم | تشير المناقشة إلى محدودية الأدلة اليونانية وتعتبر المجموعة المتجانسة نقطة قوة، لكنها لا توضح لمن تنطبق النتائج، على سبيل المثال البالغين اليونانيين البدينين الذين تم تجنيدهم في مواقع الدراسة. | المناقشة، ص 532 | تم الإبلاغ جزئياً |
| 22 التمويل ودور الممولين | يذكر المقال أن تمويل الوصول المفتوح جاء من HEAL-Link Greece وأن "هذا البحث لم يتلق أي تمويل خارجي". | التمويل، ص 532 | وذكرت |
ما توضحه الأرقام والإحصاءات في المثال
في 49 صفًا، بلغ إجمالي الحالات 17 حالة مُبلَّغ عنها، و15 حالة مُبلَّغ عنها جزئيًا، و5 حالات غير مُبلَّغ عنها، و6 حالات غير قابلة للتطبيق، و6 حالات تقديرية. من بين الصفوف الـ 18 التي أضافها برنامج STREGA، 6 حالات مُبلَّغ عنها، و4 حالات مُبلَّغ عنها جزئيًا، و3 حالات غير مُبلَّغ عنها، وحالتان غير قابلتين للتطبيق، و3 حالات تقديرية. هذه الإحصائيات خاصة بهذه الورقة البحثية فقط، وليست مؤشرًا على الجودة، وقد يقوم قارئ آخر بتغيير بعض الصفوف التقديرية.
تكمن نقاط القوة في المختبر وفي عرض النتائج بشكل كامل. يذكر المقال نظام التنميط الجيني والمختبر، ويُقدم معدل استدعاء بنسبة 100% وتطابقًا بنسبة 100% بين العينات المكررة، ويُقدم نتائج اختبارات هاردي-واينبرغ الدقيقة لكل متغير، ويُظهر كل متغير مع كل نموذج جيني. أما نقاط الضعف فتكمن في المواضع التي يتميز فيها برنامج STREGA بدقة عالية، وهي حجم الدراسة، والمقارنات المتعددة، والقرابة، والتصنيف السكاني، وعدد المراحل قبل التنميط الجيني.
لقد راجعنا الحساب
أعدنا حساب الأرقام الرئيسية من الجداول المطبوعة، باستخدام عدد الأنماط الجينية للمجموعتين الضابطة والمصابة كما هي مطبوعة. يوضح الجدول 4 أدناه القيم المطبوعة بجانب نتائجنا. يتطابق الجدولان تقريبًا في النتائج الأساسية، ويختلفان في موضع واحد.
الجدول 4. الأرقام في المثال مُعاد حسابها من الجداول المطبوعة. العمليات الحسابية من إعدادنا.
| تحقق | مطبوع في المقال | إعادة حسابنا | نتيجة |
|---|---|---|---|
| أعمدة النمط الجيني في الجدول 3 من المقالة | 136 حالة ضابطة و 121 حالة | 136 و 121 لجميع المتغيرات الثلاثة | مباراة |
| قيم مربع كاي p، الجدول 3 من المقالة | أقل من 0.001؛ 0.006؛ أقل من 0.001 | أقل من 0.001 (4.3e-9)؛ 0.0058؛ أقل من 0.001 (5.9e-5) | مباراة |
| قيم هاردي-واينبرغ الدقيقة في الضوابط، الجدول 2 من المقالة | أقل من 0.001؛ أقل من 0.001؛ 0.019 | 4.1e-8; 3.6e-18; 0.019 | مباراة |
| الأفراد غير المتماثلين المتوقعين، الجدول 2 من المقالة | 40.2 (29.5%)؛ 49.4 (36.3%)؛ 46.0 (33.8%) | 40.2 (29.5%)؛ 49.5 (36.4%)؛ 45.6 (33.6%) | اختلافات طفيفة بالنسبة لـ FTO و PPARG، لا تؤثر على قيم p الدقيقة |
| نسب الاحتمالات التراكمية، الجدول 4 من المقالة | 2.66 (1.92 إلى 3.68)؛ 1.52 (1.14 إلى 2.03)؛ 1.98 (1.41 إلى 2.77) | وبالمثل، باستخدام الانحدار اللوجستي على عدد الجدول 3 | مباراة |
| نسب احتمالات الصفات السائدة والمتنحية، الجدول 4 من المقالة | ستة تقديرات، على سبيل المثال 5.88 (من 3.08 إلى 11.22) لجين TCF7L2 المتنحي | نفس الشيء، جداول 2×2 على الجدول 3 | مباراة |
| إجمالي المجموعات في الجدول 5 من المقالة (العنوان n = 47 و n = 89) | TCF7L2 47 و 89 | TCF7L2 47 و89؛ FTO 52 و84؛ PPARG 49 و87 | لا يتطابق مع FTO و PPARG |
| قيم مربع كاي p، الجدول 5 من المقالة | 0.786؛ 0.978؛ 0.912 | 0.786؛ 0.978؛ 0.912، باستخدام الإحصاءات المطبوعة | طابق، مع العد كما هو مطبوع |
يحتاج الجدول 5 في المقالة إلى مراجعة. تتطابق الأعداد المطبوعة مع قيم p المطبوعة، لذا يكمن الاختلاف إما في عناوين الأعمدة أو في عدد اثنين من المتغيرات الثلاثة. اكتمل تحديد النمط الجيني لجميع المشاركين البالغ عددهم 257، لذا ينبغي أن يُمثل الأشخاص أنفسهم مجموعتي HbA1c نفسيهما لكل متغير، ولا تُوضح المقالة وحدها الشكل المقصود. نُشير إلى ذلك كنقطة للمراجعة وليس كخطأ في المنهجية.
التناقضات التي سيلاحظها القارئ
- يُصنّف الجدول 4 في عمود الملاحظات ثلاثة صفوف على أنها "النموذج الأساسي؛ غير المُعدّل"، وهي صفوف TCF7L2 المتنحي، وFTO السائد، وPPARG المتنحي، بينما تنص الحاشية على أن "النموذج الإضافي (لكل أليل) هو التحليل الأساسي المُحدد مسبقًا؛ أما النموذجان السائد والمتنحي فهما ثانويان". وبصيغتها المطبوعة، تتعارض هذه التصنيفات مع الحاشية ومع قسم الطرق.
- لا تتفق مجاميع المجموعات في الجدول 5 من المادة بين المتغيرات الثلاثة، كما هو موضح أعلاه.
- تحمل جملة "الأساليب" التي تقول "تم إعداد التقرير المنقح وفقًا لإرشادات STREGA" رقم المرجع 19، وهو في قائمة المراجع معايير الرعاية الخاصة بجمعية السكري الأمريكية، بينما ورقة STREGA هي المرجع 15.
- تشير المناقشة إلى أن بيانات مراقبة الجودة "تدعم الإبقاء على هذه المواقع في التحليل الاستكشافي"، بينما تشير القيود إلى أن انحرافات هاردي-واينبرغ في جميع المتغيرات الثلاثة تثير "مخاوف بشأن صحة التنميط الجيني، وتأثيرات أخذ العينات، أو بنية السكان". كلا البيانين صريح وشفاف، وعلى القارئ أن يوازن بينهما عند قراءة نسب الاحتمالات.
خمسة دروس في إعداد التقارير من المثال
صف المختبر بالطريقة التي يطلبها البند 8ب
يُظهر المثال جودة عالية في مراقبة الجودة، حيث يتضمن منصة ومختبرًا مُحددين، ونسبة استدعاء 100%، وتكرارًا في تحديد النمط الجيني لحوالي 10% من العينات. مع ذلك، لا يزال المثال يُغفل ذكر برنامج الاستدعاء وإصداره، وتخزين الحمض النووي، وأي معلومات حول الدفعات أو ما إذا تم تحديد النمط الجيني للحالات والضوابط معًا. هذه جمل قصيرة يطلبها برنامج STREGA لأن سوء التصنيف التفاضلي بين الحالات والضوابط قد ينشأ عن اختلافات في تخزين الحمض النووي أو جمعه أو معالجته، حتى عندما يكون تحديد النمط الجيني نفسه ممتازًا [1].
حدد ما تعنيه مخارج هاردي-واينبرغ قبل المناقشة.
يسأل البند 12f عما إذا كان التوازن قد أُخذ في الاعتبار وكيف، ويجيب المثال على ذلك بوضوح من خلال اختبار دقيق [4] . ويضيف مؤلفو STREGA أنه ينبغي وصف أي إجراء يسمح بالانحرافات، وأنه بالنسبة للمنصات الكبيرة، يجب تحديد العتبة المستخدمة لاستبعاد المتغيرات [1] . في المثال، تنحرف جميع المتغيرات الثلاثة عن التوازن في الضوابط، ويتم تمييز نقص التغاير الزيجوتي لاثنين منها. يحتاج القارئ إلى مراجعة قسم الطرق لمعرفة ما كان سيتم فعله في هذه الحالة، على سبيل المثال إعادة فحص الاختبار أو إجراء التحليل مع المتغير وبدونه، لأن قسم المناقشة سيتضمن حينها التفسير الكامل.
تحدث عن التعددية والتصنيف، حتى لو كانت الإجابة لا شيء.
الصفوف 12h و12i و16d هي تلك التي لم يكلف فيها سطر واحد من المؤلفين شيئًا يُذكر. ثلاثة متغيرات وثلاثة نماذج جينية تُعطي تسعة تقديرات للارتباط، ولم يذكر المقال أي تصحيح أو سبب لعدم وجود أي منها. تتم معالجة التقسيم الطبقي بتقييده بأصل واحد وفقًا لسجل الدراسة، وهو خيار مشروع كان مؤلفو STREGA يرغبون في ذكره مع توضيح كيفية تحديد الأصل. جملة تُفيد بعدم تطبيق أي تصحيح أو طريقة تقسيم طبقي، مع ذكر السبب، تُفي بالغرض.
حدد عدد المراحل والأساس الذي استندت إليه في تحديد حجم الدراسة
تُقدّم المقالة أحجام المجموعات النهائية ونسبة نجاح تحديد النمط الجيني، دون التطرق إلى أعداد العينات التي تمّت معاينتها أو استيفاؤها أو استبعادها، أو كيفية اختيار العينة رقم 257. تُمكّن هذه الحقائق الثلاث القارئ من تقييم عملية الاختيار وقوة الدراسة، وهي العناصر الأساسية في مخطط التدفق. يقوم مُولّد مخططات التدفق المجاني الخاص بنا، والمذكور أدناه، برسم مخطط STROBE من هذه الإحصاءات.
تأكد من تطابق جميع التسميات والإجماليات وأرقام الاقتباسات
التناقضات القليلة الحقيقية في المثال طفيفة، وتتمثل في عناوين الملاحظات في جدول، ومجاميع المجموعات في جدول آخر، ورقم استشهاد يشير إلى مرجع خاطئ. لا يؤثر أي منها على نسب الاحتمالات، وكلها من التفاصيل التي يتحقق منها المحررون والمراجعون أولاً. تستغرق عملية التحقق من الاتساق، والتي تشمل مقارنة كل عدد وعنوان ورقم مرجع بين الملخص والجداول والنص وقائمة المراجع، أقل من ساعة.
كيفية إكمال قائمة التحقق الخاصة بك من ستريجا
ابدأ من جدول STREGA في الورقة البحثية المتاحة للجميع، والذي يوفره المؤلفون أيضًا كملف قابل للتعديل، الجدول S1 في المعلومات الداعمة [1] . أضف صفًا واحدًا لكل عنصر، واكتب رقم قسم المخطوطة أو رقم الصفحة بجانبه، واكتب سببًا في كل صف لا ينطبق عليه. ثم اكتب فقرات علم الوراثة أدناه، بحيث تكون كل فقرة قصيرة بما يكفي لتوضع في قسم الطرق أو النتائج.
- فقرة المختبر. مصدر وتخزين الحمض النووي، وطريقة ومنصة تحديد النمط الجيني، وخوارزمية الاستدعاء وإصدارها، والمختبر، ومعدلات الاستدعاء والخطأ، وقابلية المقارنة بين المجموعات، وما إذا تم تعيين الأنماط الجينية معًا أو على دفعات.
- حكم هاردي-واينبرغ. الاختبار المستخدم، والمجموعة التي تم تطبيقه عليها، وأي عتبة لاستبعاد المتغيرات، ونتيجة كل متغير، وما فعلته عندما انفصل أحد المتغيرات.
- جملة تصنيفية. المعلومات المتعلقة بالأصول المتاحة، وكيفية التحقق منها، والطريقة المستخدمة لتقييم أو معالجة التفاوت الطبقي، أو بيان بأنه لم يتم استخدام أي منها.
- جملة متعددة. كم عدد المتغيرات والنماذج التي تم اختبارها، وما إذا تم تعديل العتبة وكيف تم ذلك.
- عدد. تمت محاولة تحديد النمط الجيني للأرقام ونجحت، وتم تحديد الأرقام لكل فئة من فئات النمط الجيني للحالات والضوابط، والمراحل التي سبقتها.
- بيان النسخ. سواء كانت الدراسة تقريراً أولياً، أو تكراراً، أو كليهما، مع تحديد معايير التكرار عند الاقتضاء.
يمكن للمؤلفين الذين يحتاجون إلى دليل التصميم أولاً استخدام دليل STROBE الخاص بنا ، كما تتوفر صفحة STREGA الرسمية على موقع شبكة EQUATOR . بيان STROBE الأصلي متاح أيضاً للجميع [6] ، ويحتوي موقع STROBE الإلكتروني على قوائم التحقق لكل تصميم (موقع بيان STROBE).
أخطاء شائعة في قائمة مراجعة ستريجا
- يذكر أن الدراسة "اتبعت منهجية STREGA" دون تقديم قائمة التحقق أو مواقع العناصر.
- الإبلاغ عن معدل الاستدعاء دون ذكر الطريقة أو المنصة أو المختبر.
- اختبار توازن هاردي-واينبرغ ثم عدم قول أي شيء عن النتيجة أو ما تعنيه بالنسبة للتحليل.
- اختبار العديد من المتغيرات أو النماذج دون بيان بشأن التعددية.
- مع ذكر أحجام المجموعات النهائية فقط واستبعاد الأرقام التي تم التواصل معها واستبعادها وتحديد نمطها الجيني.
- ترك عناوين الجداول، وإجماليات المجموعات، وأرقام الاستشهادات غير متناسقة مع النص.
أدوات بحث مجانية من Editverse
- GraphProأنشئ رسومًا بيانية جاهزة للنشر، 25 نوعًا، مع اختبار t مدمج، وتحليل التباين (ANOVA)، والارتباط، وقيم p لاختبار مربع كاي. مجاني، بدون تسجيل.
- StatPro. حاسبات إحصائية مجانية وأداة لاختيار الاختبار تغطي مقارنات المجموعات، والنتائج الفئوية، وتحليل الوقت حتى الحدث، ودقة التشخيص.
- مخطط انسيابي احترافي. قم بإنشاء مخططات التدفق PRISMA 2020 و PRISMA-ScR و CONSORT و STROBE و STARD و MOOSE و ARRIVE مباشرة في متصفحك.
الدعم المهني لمخطوطة جمعية جينية
تُسجّل قائمة التحقق محتويات الدراسة الحالية، لذا فإن مرحلة التخطيط لا تقل أهمية عن مرحلة الكتابة. يسهل حسم مسائل مثل كيفية اختيار الحالات والضوابط، وكيفية سحب العينة، وكيفية إعداد تقرير العمل المخبري قبل جمع البيانات. تُقدّم Editverse خدمتين تُناسبان هاتين المرحلتين. الأولى هي استشارة منهجية لتصميم الدراسة، والثانية هي تحرير جوهري للمخطوطة النهائية مع التحقق من قائمة المراجع. يتوافق دعم Editverse في التحرير والكتابة مع معايير اللجنة الدولية لمحرري المجلات الطبية ( ICMJE ) ولجنة أخلاقيات النشر (COPE) ومبادئ الممارسة العامة 2022 ، ومع متطلبات أخلاقيات البحث في مؤسستكم وبلدكم [7] [8].
استشارة منهجية
$400
ثلاث جلسات مدة كل منها 45 دقيقة مع متخصصين حاصلين على درجة الدكتوراه في منهجية البحث، تغطي مراجعة تصميم البحث، وأخذ العينات، وجمع البيانات، والتحقق من صحتها، مع إطار عمل منهجي مكتوب. تُعقد الجلسات على مدى 4 إلى 6 أسابيع.
التحرير المتقدم
$550
تحريرٌ شامل، وصقلٌ للغة العلمية، وتحريرٌ وفقًا لأسلوب APA أو AMA أو فانكوفر، ومراجعةٌ لقوائم المراجع. رسومٌ ثابتة، من 7 إلى 10 أيام عمل، وجولة مراجعة مجانية واحدة.
إذا كان سؤالك سؤالاً سببياً يمكن أن تجيب عليه إحصاءات ملخص GWAS العامة، فإن حزمة دراسة التوزيع العشوائي المندلي تتضمن قائمة مراجعة STROBE-MR.
خاتمة
تحتفظ قائمة التحقق STREGA بجميع بنود STROBE الـ 22، وتضيف نصًا جينيًا إلى 12 منها، لتمكين القارئ من تقييم كيفية التعامل مع الحمض النووي، وعدد العينات التي تم تحديد نمطها الجيني، وما إذا كانت أعداد الأنماط الجينية تتوافق مع التوازن، وكيفية معالجة الأصل، وعدد المتغيرات التي تم اختبارها. عند تطبيقها على دراسة حالة-مراقبة حقيقية متاحة للجميع، تُظهر القائمة معايير التقرير الجيد، مع ذكر اسم المنصة والمختبر، ومعدل استدعاء كامل، وتحديد النمط الجيني المكرر، وعرض كل متغير تحت كل نموذج. كما تُظهر القائمة مواطن الخلل حتى في الأبحاث الدقيقة، وتحديدًا حجم الدراسة، والتعددية، والقرابة، والتصنيف، وأعداد المراحل، بالإضافة إلى مواطن التناقضات الطفيفة. أكمل الجدول قبل التقديم، واكتب سببًا في كل صف لا ينطبق، وتحقق من كل عدد، وعنوان، ورقم استشهاد في النسخ النهائية.
الأسئلة الشائعة حول قائمة مراجعة ستريجا
كم عدد العناصر التي تتضمنها قائمة التحقق الخاصة بـ STREGA؟
يحتفظ هذا المعيار بالبنود الـ 22 من قائمة التحقق الخاصة بـ STROBE، ويضيف نصًا خاصًا بعلم الوراثة إلى 12 منها، وفقًا لبيان عام 2009. وبحسب إحصائنا، يبلغ عدد الإضافات 18 سطرًا، بما في ذلك البنود الفرعية الجديدة من 12f إلى 12j، و16d، و17b، و17c.
هل تحل قائمة التحقق الخاصة بـ STREGA محل قائمة STROBE؟
لا. إنه امتداد، ويحتوي جدول STREGA على صياغة STROBE إلى جانب الإضافات الجينية، لذا فإن جدولًا واحدًا مكتملًا يغطي كليهما.
هل تنطبق قائمة التحقق الخاصة بـ STREGA على دراسات الارتباط على مستوى الجينوم؟
نعم. يتناول المؤلفون الدراسات على مستوى الجينوم بشكل مباشر، على سبيل المثال من خلال طلب العتبات المستخدمة لاستبعاد المتغيرات وملخص لجميع المتغيرات التي تم فحصها عندما تم اختبار العديد منها.
هل تُستخدم قائمة التحقق الخاصة بـ STREGA للتوزيع العشوائي المندلي؟
لا. الدراسات العشوائية المندلية لها إرشاداتها الخاصة، STROBE-MR، والتي تتكون من 20 بندًا.
هل قائمة التحقق الخاصة بـ STREGA هي مقياس للجودة؟
لا، إنما يسجل هذا المقياس اكتمال التقرير، ولا يُقيّم جودة الدراسة. فعدد الصفوف المُبلغ عنها وغير المُبلغ عنها يصف ورقة بحثية واحدة، ولا ينبغي تحويله إلى مقياس.
أين يمكن العثور على قائمة التحقق الرسمية لشركة STREGA؟
البيان متاح للجميع في PLoS Medicine بموجب ترخيص CC0، مع نسخة قابلة للتحرير من الجدول في المعلومات الداعمة، وهو مدرج على موقع EQUATOR Network.
ما الذي أغفلته ورقة البحث النموذجية في أغلب الأحيان؟
في مثالنا العملي، كانت الفجوات الأكثر وضوحًا هي الأساس لحجم الدراسة، والمقارنات المتعددة، والقرابة، وعدد المراحل قبل تحديد النمط الجيني، والتعامل مع التقسيم السكاني.
مراجع حسابات
- ليتل جيه، هيغينز جيه بي تي، إيوانيديس جيه بي إيه، موهر دي، غانيون إف، فون إلم إي، وآخرون. تعزيز الإبلاغ عن دراسات الارتباط الجيني (STREGA): امتداد لبيان STROBE. PLoS Med. 2009؛6(2):e1000022. doi:10.1371/journal.pmed.1000022. PMID: 19192942. PMCID: PMC2634792. CC0. صفحة الناشر.
- كاليسيس ك، رويدوس ب، نيكولوبولوس ف، كاتسيكي ن، كوتسا ك، كوفاكيس ت. الخلفية الوراثية للسمنة: دراسة حالة-مراقبة. الهرمونات (أثينا). 2026؛25(2):527-33. doi:10.1007/s42000-026-00790-3. PMID: 42230483. PMCID: PMC13582106. CC BY 4.0. صفحة الناشر.
- نيدوفيتش د، بانيك ن، باستورينو ر، ريتشارد و، بوتشيا س. تقييم اعتماد بيان تعزيز الإبلاغ عن دراسات الارتباط الجيني (STREGA) بشأن جودة الإبلاغ عن دراسات الارتباط الجيني المنشورة. مجلة علم الأوبئة. 2016؛26(8):399-404. doi:10.2188/jea.JE20150173. PMID: 27349199. PMCID: PMC4967660. تم الاستشهاد بالحقائق فقط. صفحة الناشر.
- ويغينتون جيه إي، كاتلر دي جيه، أبيكاسيس جي آر. ملاحظة حول الاختبارات الدقيقة لتوازن هاردي-واينبرغ. المجلة الأمريكية لعلم الوراثة البشرية. 2005؛76(5):887-93. doi:10.1086/429864. صفحة الناشر.
- سكريفانكوفا، في دبليو، وريتشموند، آر سي، وولف، بي إيه آر، ويارمولينسكي، جيه، وديفيز، إن إم، وسوانسون، إس إيه، وآخرون. تعزيز الإبلاغ عن الدراسات الرصدية في علم الأوبئة باستخدام التوزيع العشوائي المندلي (STROBE-MR). مجلة الجمعية الطبية الأمريكية. 2021؛326(16):1614-21. doi:10.1001/jama.2021.18236.
- فون إلم إي، ألتمان دي جي، إيغر إم، بوكوك إس جيه، غوتشه بي سي، فاندنبروك جيه بي. بيان تعزيز الإبلاغ عن الدراسات الرصدية في علم الأوبئة (STROBE): إرشادات لإعداد تقارير الدراسات الرصدية. PLoS Med. 2007؛4(10):e296. doi:10.1371/journal.pmed.0040296.
- اللجنة الدولية لمحرري المجلات الطبية. توصيات بشأن إجراء البحوث العلمية وكتابة التقارير عنها وتحريرها ونشرها في المجلات الطبية. متوفرة على الموقع الإلكتروني icmje.org/recommendations.
- ديتورا إل إم، توروسر دي، سايكس إيه، فاندرليندن سي، بلانكيت إف جيه، لين تي، وآخرون. إرشادات ممارسات النشر الجيدة (GPP) للبحوث الطبية الحيوية الممولة من الشركات، تحديث 2022. حوليات الطب الباطني. 2022؛175(9):1298-1304. doi:10.7326/M22-1460. PMID: 36037471.
